按照国家规定，不仅要对“三公经费”的预决算进行严格管理，也要对其财务管理进行强化。
在进行“三公经费”核算时，既要按照《行政单位会计制度》和《政府收支分类科目》设置相关明细账户，又要按照会计核算的相应要求进行处理。
在明细账户的设置方面，应当在“经费支出”总账科目下设置“财政拨款支出”和“其他资金支出”等两个一级明细科目，借以反映“三公经费”的资金来源。
在“财政拨款支出”一级明细科目下设置“基本支出”和“项目支出”两个二级明细科目，用来反映资金的去向。
在“基本支出”明细科目下按照当年《政府收支分类科目》中“支出经济分类”的款级科目设置如下明细账：商品服务支出—— —因公出国(境)费、维修(护)费、公务接待费、公务用车运行维护费等，或者其他基本建设支出—— —公务用车购置等。
同时，在“项目支出”二级明细科目下按照具体项目进行明细核算，必要时设置三、四级明细科目如其他基本建设支出—— —公务用车购置(财政直接支付)等。
另外，行政单位还应设置“财政拨款支出备查簿”：一方面逐笔登记每一项“三公经费”的发生所形成财政拨款支出的具体情况，借以反映每个会计期末的财政拨款结转与结余情况，另一方面又可为“财政拨款 收入支出表”的编制提供依据。
例1：某市行政机关2015年1月将有一辆奥迪轿车(原值30万元)使用年限届满，应予以报废。
应将轿车的购置费纳入2015年度的预算：编制预算时要根据国货优先的原则对国产轿车市场价格进行调查，通过调查25万元的H7型红旗轿车符合现行政策规定。
履行报废审批手续：填制车辆报废报告连同车管部门出具的年检不合格《机动车报废证明》经主管部门审核同意后上报财政部门;财政部门审核并经技术鉴定后，通知单位将报废车辆送交报废汽车回收拆解企业，取得拆解收入为8000元。然后由单位向财政部门提供《报废汽车回收证明》和公安交警车辆管理部门出具的《机动车注销证明》;财政部门再在《行政事业单位国有资产处置审批单》签署意见。财政部门的审批意见为“无法调剂，同意购买”。
再次政府采购时，经过政府采购程序购入H7型红旗轿车一辆，发票金额为23.6万元，已经办理了验收手续。
会计分录应为(单位均为“万元”)：
